Per part de l’acusació de la CUP, que està en mans de l’advocat Benet Salellas, s’ha citat a declarar a diversos militants de l’organització que van ser a la seu de la formació aquell dia, entre ells a l’exdiputat David Fernàndez. L’acusació també ha citat a declarar a l’advocat Àlex Solà que va formar part de l’equip legal que va assessor a la CUP durant el setge i que va intentar fer de mediador amb l’operatiu policial.
L'Audiència de Barcelona va ordenar reobrir la investigació sobre el setge el passat mes de gener, després que el febrer del 2018 un jutge arxivés la denúncia que havia interposat el partit, al considerar que els agents "es van limitar a intervenir el material propagandístic en compliment de la instrucció de la Fiscalia". Davant del recurs de la CUP, l'Audiència de Barcelona, va reobrir la causa al considerar que aquells fets del 20-S podrien ser constitutius d'un delicte de coaccions greus.